Vysvětleno: Co je nová podřada AY.12 varianty Delta a měli byste se o to starat?

Varianta Delta (B.1.617.2) dala vzniknout několika podliniím nazývaným varianty „Delta Plus“, které nesou většinu jejích charakteristických mutací, ale liší se v jiných ohledech. Jedna z těchto podlinií, AY.12, má všechny charakteristické delta mutace kromě jedné.

Lidé stojí ve frontě, aby dostali dávku vakcíny proti Covid-19 v dočasném očkovacím centru zřízeném ve škole v Bombaji, úterý 17. srpna 2021. (PTI Photo/Kunal Patil)

Protože svět nervózně sleduje všechny nové varianty Covid-19 a jeho podskupiny, každý vzorek viru je technicky novou „variantou“, protože jeho sekvence se neshoduje se sekvencí žádného jiného viru.

Nyní vědci rozšířili rodinu Delta ze čtyř na 13 variant. Některé případy Delta varianta , nejrozšířenější varianta znepokojení v Indii, jsou reklasifikovány do jiné podskupiny — AY.12 — která byla spojována s velkým počtem případů v Izraeli, konsorcium Indie SARS-CoV-2 Genome (INSACOG), která sleduje vznikající varianty, uvedl ve zprávě.

Protože je však definice AY.12 nekonzistentní, konečná čísla budou nějakou dobu trvat, uvedlo prohlášení konsorcia.

Co je tedy tato mutace AY.12?

Virová evoluce v zásadě funguje jako každý jiný druh. Jak se virus šíří tělem, vytváří své kopie, které mají často drobné chyby a změny.

Varianta Delta (B.1.617.2) jako taková dala vzniknout několika podřadám nazývaným varianty „Delta Plus“, které nesou většinu jejích charakteristických mutací, ale liší se jinými způsoby. Jedna z těchto podlinií, AY.12, má všechny charakteristické delta mutace kromě jedné.

Nárůst případů v Izraeli je znepokojivý, protože je to země, kde je téměř 60 % dospělých plně očkovaných, a uvádí, že účinnost vakcíny Pfizer v této zemi je výrazně nižší, než se ukázalo během klinických studií. Reklasifikace má primárně pomoci mikroepidemiologii a není založena na získávání významných mutací. V současnosti tedy není známo, zda je AY.12 klinicky odlišný od Delta, uvádí zpráva INSACOG. V spike proteinu (S) nebyly zaznamenány žádné nové mutace, které by vyvolávaly obavy. Jeho rychlý růst v Izraeli však znamená, že by měl být dále zkoumán.

Je nějaký rozdíl mezi AY.12 a ostatními kmeny?

Podle INSACOG zatím není známo, zda je AY.12 klinicky odlišný od Delta nebo B.1.617.2.

AY.12 však ztratil některé z mutací pozorovaných v linii Delta, jako je G142D v spike proteinu. V spike proteinu této varianty nejsou zaznamenány žádné nové mutace, které by vyvolávaly obavy.

AY.12 je v současnosti nejdominantnějším kmenem v Izraeli — 51 procent studovaných vzorků prokázalo prevalenci této varianty. Na základě počtu sekvencí, které do GISAID dosud nahrály indické výzkumné skupiny, se prevalence této varianty za poslední týden zvýšila na více než 20 procent.

Zatímco požádal státy, aby zachovaly opatrnost a hlídaly si tuto variantu, INSACOG řekl: AY.12, v mnoha státech je vidět přeřazená sub-linie Delta, ale čísla potřebují bližší prozkoumání. Funkční dopad změn mezi Delta a AY.12 není znám, ale zdá se, že tyto dva jsou na molekulární úrovni velmi podobné.

Dosud bylo podle INSACOG sekvenováno asi 70 000 vzorků koronavirů na jejich genomovou strukturu, z nichž 50 000 bylo přiděleno různým liniím. Přibližně 60 % z nich se skládá z mezinárodních variant zájmu nebo zájmu (VoC nebo VoI), které jsou globálně sledovány a spojeny s propuknutím onemocnění, stejně jako s případy průlomu vakcíny a reinfekcí. V rámci těchto VoC obsahuje varianta Delta 70 % vzorků. Případy Delta plus, ve kterých je zahrnut AY.12, mají pouze číslo 67, i když se očekává, že po reklasifikaci naroste.

Sledování vývoje

Outbreak.org, který sleduje nové varianty a jejich prevalenci, uvádí, že první případ linie AY.12 byl zaznamenán 7. září 2020. Od té doby bylo po celém světě do srpna detekováno 44 083 sekvencí v linii AY.12. 26.

Varianta se však dostala do popředí poté, co se stala dominantním kmenem v Izraeli. Čtvrtá vlna infekcí se rychle blíží úrovním nejhorších dnů pandemie v Izraeli minulou zimu. Denní míra potvrzených nových případů viru se za poslední dva týdny více než zdvojnásobila, což z Izraele dělá rostoucí horké místo na mezinárodních žebříčcích. Tento týden byla obnovena omezení pro shromáždění a obchodní a zábavní místa a vláda zvažuje nové uzamčení.

Většinu expertů však znepokojuje to, že vysoká míra infekcí v Izraeli mezi ranými příjemci vakcíny může ukazovat na slábnutí ochrany vakcínou v průběhu času, což přispělo k rozhodnutí USA začít Američanům nabízet posilovací dávky od příštího roku. Měsíc. Vakcína může být méně účinná při prevenci infekce vysoce nakažlivou variantou A.12 Delta, která je nyní primární verzí viru v Izraeli.

Údaje zveřejněné izraelským ministerstvem zdravotnictví na konci července naznačují, že Pfizer shot byl pouze 39% účinný proti infekci v zemi koncem června a začátkem července, ve srovnání s 95% od ledna do začátku dubna. V obou obdobích však byla injekce více než 90% účinná v prevenci závažných onemocnění. Izrael jako takový nyní vkládá své naděje do boosterů.

Podle Outbreak.org pochází první vzorek AY.12 v Indii ze 7. září 2020.

INSACOG dosud sekvenoval 67 699 vzorků viru z Indie, z nichž 50 869 bylo podrobně analyzováno. Dalších 11 016 sekvencí vzorků bylo sdíleno státními vládami – celkový počet sekvenovaných vzorků je tedy 78 865.

Znepokojivým trendem však je, že vzhledem k tomu, že v Indii bylo dosud nakaženo více než 3,2 milionů lidí, bylo dosud sekvenováno pouze asi 0,002 % vzorků.

Co je důležité pro obecné lidi?

Ne všechny varianty, které Světová zdravotnická organizace uznala, jsou stejně špatné. Když organizace pojmenuje novou rodinu, přidá také štítek, který nám říká, jak bychom se měli bát.

Nejnižší úroveň je variantou zájmu, což znamená, že se vyplatí ji sledovat. Uprostřed je varianta obav, jako Delta, která se vyvinula jako nebezpečnější. Zájmové varianty často dostávají toto označení, protože sdílejí mutaci s variantami, které jsou předmětem zájmu – jsou pod dohledem. CDC má další, přísnější kategorii, variantu s vysokými důsledky, která nikdy nebyla dána rodině Covida. Je vyhrazena pro potenciální budoucí kmeny, které by mohly způsobit vážná onemocnění u očkovaných lidí, neprokázaly se na běžně používaných diagnostických testech nebo možná odolávaly vícenásobné léčbě symptomů covidu.

Mutace se vyskytují náhodně napříč genomy virů u všech milionů infikovaných lidí. Některé z těchto mutací zaniknou a několik se rozšíří na další lidi. Vědci jako takové bedlivě sledují vzory v Deltě, zejména proto, že se šíří tak rychle.

Zpravodaj| Kliknutím dostanete do své doručené pošty nejlepší vysvětlivky dne

Sdílej Se Svými Přáteli: