Vysvětleno: Co je to ‚hodnota CT‘ v testu na Covid-19 a proč je to důležité?

Prahová hodnota cyklu se objevuje v testech RT-PCR na koronavirus a určuje, zda je osoba pozitivní na Covid-19 nebo ne. Do jaké míry to koreluje s virovou zátěží a závažností onemocnění?

RT-PCR test detekuje virus; Hodnota Ct nastavuje měřítko pro to, zda má být osoba považována za pozitivní. (Expresní foto: Amit Mehra)

Jedním z různých vědeckých termínů, které se pandemie Covid-19 stala součástí veřejného slovníku, je „hodnota Ct“ v testech RT-PCR pro určení, zda je pacient pozitivní na Covid-19.

To bylo předmětem nedávné žádosti zaslané vládou státu Maháráštra Indické radě pro lékařský výzkum (ICMR). Stát se snažil objasnit, zda je vhodné léčit osobu jako Covid-negativní, pokud je hodnota Ct vyšší než 24 a osoba je asymptomatická. Státní úředníci uvedli, že různé dokumenty ICMR zmiňovaly různé hodnoty Ct a dokonce i mezi Niti Aayog a Národním centrem pro kontrolu nemocí existují rozdílné názory.

O několik dní později generální ředitelství ICMR odepsalo státnímu ministru zdravotnictví, že ICMR převzalo informace od virologických laboratoří po celé zemi, aby dospělo k jediné mezní hodnotě Ct. Všichni pacienti s hodnotou Ct nižší než 35 mohou být považováni za pozitivní, zatímco pacienti s hodnotou Ct nad 35 mohou být považováni za negativní, uvedl ICMR.

Ale jaká je hodnota Ct?

Zkratka pro prahovou hodnotu cyklu, Ct je hodnota, která se objevuje během testů RT-PCR, zlatého standardu pro detekci koronaviru SARS-CoV-2. Při testu RT-PCR se RNA extrahuje z výtěru odebraného od pacienta. Poté se přemění na DNA, která je následně amplifikována. Amplifikace se týká procesu vytváření více kopií genetického materiálu — v tomto případě DNA. To zlepšuje schopnost testu detekovat přítomnost viru. Amplifikace probíhá v sérii cyklů – z jedné kopie se stanou dvě, ze dvou se stanou čtyři atd. – a po několika cyklech se vytvoří detekovatelné množství viru.

Podle doporučení ICMR je hodnota Ct reakce RT-PCR počet cyklů, ve kterých je detekovatelná fluorescence produktu PCR nad signálem pozadí. Zjednodušeně řečeno, hodnota Ct označuje počet cyklů, po kterých lze virus detekovat. Pokud je vyžadován vyšší počet cyklů, znamená to, že virus zůstal nedetekován, když byl počet cyklů nižší. Čím nižší je hodnota Ct, tím vyšší je virová zátěž – protože virus byl zaznamenán po méně cyklech.

Zpravodaj| Kliknutím dostanete do své doručené pošty nejlepší vysvětlivky dne

Proč je hodnota CT důležitá?

Abychom to uvedli do kontextu, podívejme se na doporučení ICMR a dopis Maháráštry adresovaný ICMR. Podle ICMR je pacient považován za pozitivního na Covid, pokud je hodnota Ct nižší než 35. Jinými slovy, pokud je virus detekovatelný po 35 cyklech nebo dříve, je pacient považován za pozitivního. Pokud by měl být benchmark snížen na 24 – hodnotu uvedenou v dopise Maháráštry – znamenalo by to, že hodnoty Ct v rozmezí 25–34 by nebyly považovány za pozitivní. Referenční hodnota 35 proto znamená, že více pacientů by bylo považováno za pozitivních, než bychom získali, kdyby referenční hodnota byla 24. ICMR uvedla, že snížení prahového parametru Ct může vést k chybějícím několika infekčním osobám.

Hodnotu Ct lze považovat za měřítko přenosového potenciálu, řekl přední virolog Dr Shahid Jameel. Takže pokud je v mém krku a nosu více viru, přenesu ho lépe, řekl Dr Jameel, který je ředitelem Trivedi School of Biosciences na univerzitě Ashoka.

Jaký je význam prahu ICMR 35?

Celosvětově se přijatá mezní hodnota Ct pro Covid-19 pohybuje mezi 35 a 40 v závislosti na pokynech od příslušných výrobců testovacích zařízení. ICMR dospěla k hodnotě Ct 35 na základě laboratorních zkušeností a vstupů získaných z několika virologických laboratoří.

Neexistovalo žádné nové doporučení, ale ICMR informovalo vládu státu Maháráštra, že není vhodné používat parametr nižší prahové hodnoty cyklu, protože by to vedlo ke ztrátě několika infekčních osob a zvýšení přenosu onemocnění, řekl Dr. Balram Bhargava, generální ředitel ICMR.

Existuje nějaká korelace mezi hodnotou Ct a závažností onemocnění?

Ne. Ačkoli hodnota Ct nepřímo koreluje s virovou zátěží, nemá to žádný vliv na závažnost onemocnění, uvedli odborníci. Pacientka může mít nízkou hodnotu Ct, což znamená, že její virová nálož je dostatečně vysoká, aby byla rychle detekována, ale stále může být asymptomatická.

Malá studie zveřejněná v Indian Journal of Medical Microbiology letos v lednu zjistila, že neexistuje žádná korelace mezi hodnotami Ct a závažností onemocnění nebo úmrtností u pacientů s onemocněním Covid-19. Zjistilo se, že doba od nástupu příznaků má silnější vztah k hodnotám Ct ve srovnání se závažností onemocnění.

Hodnota Ct nám říká o virové zátěži v krku a ne v plicích, řekl Dr. Parikshit Prayag, konzultant pro infekční onemocnění v nemocnici Deenanath Mangeshkar v Pune. Hodnota Ct nekoreluje se závažností – pouze s infekčností. V první zprávě se opravdu nedívám na hodnotu Ct, ale pro sledování pacientů v nemocnici hodnotu Ct zvažuji, protože se pak mohu rozhodnout, zda pacienta přemístím do non-Covid budovy nebo ne. . Z hlediska infekčnosti na tom může záležet, ne na závažnosti, řekl doktor Prayag.

Znamená vysoká hodnota Ct vždy nízkou virovou nálož?

I když to může být zřejmý závěr, někteří odborníci zdůrazňují, že někteří pacienti mohou mít vysokou hodnotu Ct, a přesto mají velmi významnou úroveň infekce Covid-19 a naopak. Při interpretaci testu RT-PCR je důležitých mnoho faktorů a výsledky mohou také záviset na metodě odběru vzorku a době od infekce po odběr a analýzu.

Poradenství ICMR v srpnu loňského roku poznamenalo, že hodnoty Ct závisí na tom, jak byl vzorek odebrán. Špatně odebraný vzorek může odrážet nevhodné hodnoty Ct. Kromě toho jsou hodnoty Ct určeny také technickou způsobilostí osoby provádějící zkoušku, kalibrací zařízení a analytickými schopnostmi tlumočníků.

Opět platí, že hodnoty Ct se mohou lišit mezi nazálními a orofaryngeálními vzorky odebranými od stejného jedince. Teplota při přepravě, stejně jako doba od odběru do přijetí do laboratoře, může také nepříznivě ovlivnit hodnoty Ct.

Sdílej Se Svými Přáteli: